1、治疗
MC目前没有特殊效果的药物治疗。许多学者认为，MC是良性可逆性的非炎症性肠粘膜病变，随着便秘症状的改善和腹泻药的停止，大量脂褐素通过溶解酶体消化、分解，MC的色素沉着减轻或消失。因此，建议多吃蔬菜、水果和纤维丰富的饮食，多喝水，多锻炼，减少便秘和排便困难，养成良好的排便习惯，无效或不含色素的腹泻药改用油性腹泻药，必要时用胃肠动力药和微生态制剂等药物治疗便秘直肠前突、直肠内套叠等可能引起黑色疾病的原因应予以治疗，如直肠前突修补、内套固定术等。对于被诊断为MC的患者，应定期跟踪肠镜，及时发现伴有结肠息肉、腺瘤和肠癌，并在早期内镜下进行高频切割或手术根除治疗。但是，对于没有服用腹泻药史的患者，治疗方法需要进一步探讨。
2、预后
很多学者认为结肠黑变病是良性的可逆性损害，需要与结肠癌并存，定期跟进结肠镜。